El segundo, GX, tiene lugar en la misma ciudad, solo unos años después de los eventos de la primera serie. Kaiba fundó Duel Academy, Jaden se encuentra con Yugi en el primer episodio, Pegasus aparece en un momento y la serie termina con un duelo entre Jaden y Yugi.
La 3ra, 5Ds, también tiene lugar en la misma ciudad. Kaiba y Yugi son mencionados varias veces, pero nunca aparecen, creo. También hace referencia a Duel Academy, pero no a la misma.
La película 3D Bonds Beyond Time tiene a Yugi, Jaden y Yusei reunidos.
Zexal corta completamente todos los lazos con series anteriores. Por lo que sabemos, podría tener lugar en otro universo.
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Arc-V nunca ha hecho referencia directa a ninguna de las series anteriores de Yugioh, pero se encuentran con versiones alternativas del universo de personajes anteriores. Vuelven personajes populares como Jack y Crow, y otros dos cameo, pero en realidad no son los mismos personajes. A medida que avanza la serie, los personajes de GX y Zexal probablemente aparecerán.