Película 1: Bruce Wayne adopta a dos niños, Dick Grayson y Tim Drake, después del agujero vacío en su corazón donde solían residir sus padres y su ex hijo adoptivo (que era el difunto Jason Todd). Después de que los dos niños conectan a su padre adoptivo, las luchas de Batman contra Penguin y el cambio repentino de Wayne Enterprises de querer dejar de jugar, encuentran la Baticueva y piden ayuda. Después de una escena emocional de Bruce recordando a Jason y luego a los niños diciéndoles una lección de vida, Dick Grayson se convierte en el Robin, mientras que Tim Drake se convierte en el Robin Rojo.
Película 2: un asociado de Ra’s al Ghul les dice a la familia Wayne (o como Tim la llama Bat-Family) que Talia al Ghul ha tenido un hijo; El padre es Bruce. Después de que Talia es asesinada por un misterioso equipo de asesinos aparentemente liderados por el supuesto Riddler muerto, el rebelde Damien al Ghul es enviado a vivir a Wayne Manor. Al principio es irritante e inmaduro, pero poco a poco aprende los valores de aprecio y amor. Pero giro de la trama: The Riddler todavía está muerto, y el escurridizo loco detrás de la muerte de Talia es un nuevo villano, que se hace llamar el Sombrerero Loco (interpretado por Matt Smith). Doble giro de la trama, descubrió una fórmula científica que la mente controla a las personas, y usó a la fuerza a Dick como su topo. Cue la escena emocional obligatoria donde el ser querido sale de la hipnosis después de un conmovedor discurso de Damien. Mad Hatter muere de un escurridizo golpe tóxico en el cuello, pero no sin antes decirle a la Familia Bat que él y Penguin fueron manipulados. Luego les advierte lo siguiente: “The Hood está llegando”. Dick, sintiéndose culpable por ser accidentalmente el topo, pasa el papel de Robin a Damien. Se une a un viejo amigo para hacerse un nuevo nombre: Nightwing, patrullando las calles de Gotham y Blüdhaven.
Película 3: Una nueva amenaza emerge en Gotham, lo que llama la atención de Batman, Batman, Robin, Red Robin, Nightwing y la novia de Dick (que también es un nuevo superhéroe). Llamándose a sí mismo Red Hood, parece saber todo sobre Batman; su identidad, sus tácticas, y lo suficientemente aterradora: su ubicación. De manera similar a un villano del pasado de Batman, Red Hood desata todos los archienemigos de Batman sobre él (a través del uso de las ciencias de control mental de Mad Hatter). Uno de ellos es el aterrador Joker, el némesis absoluto de Batman. Finalmente, el Capucha Roja se revela como Jason Todd, y le dispara a Batgirl en ambas rótulas. Devastado, Batman se retira y dice que no puede detener un crimen. Pero todos todavía le dan esperanza, como siempre lo ha hecho. Con el equipo (y un nuevo hacker llamado Oracle, también conocido como la Batgirl lisiada), destruyen el equipo de Red Hood y lo encierran en la Penitenciaría de Blackgate. Aunque Jason afirma haber sido forzado a hacer esto contra su voluntad por un tipo llamado Mobius, Batman lo descarta. La familia Bat está ahora unida en el amor familiar eterno, amándose durante el día y luchando contra el crimen en la noche.
ESCENA POST-CRÉDITOS: Batman recibe alertas de cada computadora en la Baticueva, algún tipo de ser está interfiriendo con toda la tecnología en las siguientes siete ciudades: Gotham City, Metropolis, Gateway City, Coast City, Central City, Detroit y Amnistía Bay. Bautizando a esta entidad como el Anti-Monitor, Batman reúne un equipo de superhéroes para prepararse para esta amenaza extradimensional.
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