Esto, como siempre, depende del escritor, pero yo diría que son iguales.
Se ha demostrado que Logan puede regenerarse de casi cualquier cosa. En Civil War, Logan persiguió al villano Nitro y lo enfrentó. Nitro explotó, incinerando a Logan aparte de su esqueleto de adamantium. Solo le tomó unos momentos regenerar su cuerpo.
Y en los cómics de Old Man Logan, Hulk terminó devorando a Logan. Presumiblemente un par de horas después, Logan se regeneró y salió de la espalda de Hulk.
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Deadpool tampoco se queda atrás cuando se trata de regeneración. Le ha llevado balas a la cabeza que lo han incapacitado por unos instantes, le han volado la cabeza e incluso le han restaurado el cuerpo después de haberse desintegrado. La diferencia entre Deadpool y Logan es que Deadpool es aparentemente consciente mientras su regeneración está en efecto, principalmente debido a que es un alivio cómico. Logan, por otro lado, está casi muerto.