Los genin se colocan en celdas de cuatro hombres, o escuadrón, que consta de tres genin y un jōnin-sensei, para aprender el trabajo en equipo y experimentar la verdadera vida ninja bajo la supervisión y protección de un shinobi de élite. La composición de estos equipos se basa en las habilidades individuales de los genin, por lo que habrá un equilibrio entre los equipos. Por ejemplo, Naruto Uzumaki, quien aprobó con las calificaciones más bajas, se puso en un equipo con Sasuke Uchiha y Sakura Haruno, quienes aprobaron con las calificaciones más altas y los puntajes más altos del examen escrito, respectivamente.
No hay una regla establecida que tenga que ser 2 hombres y 1 mujer, sino que se basa en habilidades individuales. El Equipo Samui, por ejemplo, consta de 2 mujeres y 1 hombre o el antiguo Equipo Ino – Shika – Chō consta de 3 hombres.