No es una clasificación de ningún tipo, solo creo que son los mejores episodios en orden cronológico. (Nombre del episodio – Número del episodio)
- Sonata a la luz de la luna – 11
- Estuche de asesinato de línea de lujo – 22,23
- Mountain Villa Vended Man – 34,35
- Duende de la niebla – 52
- Holmes Freak – 57,58
- Barón Nocturno – 68,69,70
- Familia Distingushed – 77,78
- Caso de amenaza de estadio – 130,131
- Mansión Tottori Spider – 166,167,168
- Sinfonía asesinato en serie – 174
- Reunion With the BO – 176,177,178 (Parcela principal)
- Avivamiento desesperado – 188-193
- El secreto sellado de Megure – 217,218
- Osaka Double Mystery – 263
- Asesinatos en serie de Naniwa – 118
- El caso de Kudo Shinichi en Nueva York – 286,287,288
- 12 millones de rehenes – 304
- Contacto con el BO – 309,310,311 (Parcela principal)
- Estuche Red Horse – 325,326,327
- Frente a frente con el BO – 345 (trama principal)
- Black Impact – 425 (Parcela principal)
- Shadow of the BO – 462-465 (Trama principal)
- Deducción en la pista de esquí – 490
- Choque de rojo y negro – 491-504 (trama principal)
- Fuurinkazan – 516,517
- Cicatriz del pasado – 532-535
- Choque silencioso – 578-581 (trama principal)
- Perro Demonio – 611,612,613
- London Arc – 616-621
- Nocturno del detective – 671,672,673 (trama principal)
- Transmisión que amenaza la vida – 681-683
- Jet Black Mystery Train – 699-704 (Parcela principal)
- Mujer roja – 754-756
- Estuche de acuario – 772,773
- Scarlet Arc – 779-783 (Parcela principal)
- Kamaitachi y Kawanakajima – 808-812
Estos casos utilizan casi todos los famosos tropos de los programas de detectives, y también presentan algunos nuevos.