A pesar de haber visto bastante anime, no estoy exactamente seguro de a qué expresión / modales te refieres con esta pregunta. ¿Te refieres a la costumbre de parpadear durante los momentos socialmente incómodos, o más bien parpadear en momentos extraños en el tiempo?
Porque fuera de mi cabeza, no estoy al tanto de ningún comportamiento parpadeante específico del anime en momentos socialmente incómodos. Los personajes tienen muchas maneras de mostrar vergüenza o inquietud, pero el parpadeo no es exactamente el más importante.
¿Quizás te refieres a una expresión específica?
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En caso de que sea una expresión específica, ¿está presente en esta imagen?
¿Si es así, Cuál? 
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Apéndice:
Hay un hábito de ” parpadear de sorpresa ” que se llama ” pachikuri ”:
Sin embargo, esto no está relacionado con situaciones incómodas , solo se trata de ser abatido / sorprendido.