Respuesta corta: es el diseño pictórico en los flancos de un pony. En cuanto a lo que significa, hay todo tipo de mitología que rodea el concepto, aunque a nivel de escuela primaria, a los potros se les enseña que la cutie mark aparece cuando los ponis descubren una característica única que se distingue de los demás. Está relacionado de alguna manera con la ocupación de uno, aunque a veces de manera metafórica: vea, por ejemplo, las tres flores sonrientes de la maestra Cherilee, lo que, dice, significa que sus estudiantes están destinados a florecer. Por otro lado, existe un ejemplo de ponis que cambian sus cutie marks, debido al intento de Twilight Sparkle de seguir un viejo hechizo ideado por Star Swirl the Bearded, causando estragos en la comunidad. (El descubrimiento de Twi de una solución a este problema, de hecho, ganó su ascensión a la realeza).
Las marcas están ocasionalmente abiertas a interpretación. En el episodio más reciente, un pony con una herradura invertida supone que es un signo de mala suerte; de hecho, su torpeza general es ideal para una vida como payaso de rodeo.