¿Estaba el Capitán Marvel en Capitán América: Guerra Civil?

No.

Hay una serie de personajes en el universo Marvel que tienen el título de Capitán Marvel. El original, Mar-Vell, era un guerrero Kree (el Kree es una raza alienígena que apareció en Agents of SHIELD. Los hijos de Mar-Vell, Genis-Vell y Phylla-Vell, también han tenido el título, junto con Monica Rambeau (un teniente de policía de Nueva Orleans), Khn’nr (un Skrull, transformado en la forma de Mar-Vell, cuyo condicionamiento mental lo dejó convencido de que ERA Mar-Vell), y Noh-Varr (un Kree que tenía el título) como parte de los Dark Avengers, y se fue cuando se dio cuenta de que sus compañeros de equipo eran supervillanos).

La actual Capitana Marvel en los cómics de Marvel es Carol Danvers, una oficial de la Fuerza Aérea convertida en superheroína que durante mucho tiempo ha sido conocida como la Sra. Marvel. Carol aparecerá en el Marvel Cinematic Universe interpretado por Brie Larson; sin embargo, su película en solitario no se lanzará hasta 2019. Es posible que ella pueda aparecer en un pequeño papel en otra película antes de eso, pero como ahora sabemos, Civil War no fue uno de ellos.