Uchiha Madara es uno de los cofundadores de la Aldea Oculta de la Hoja junto con Hashirama Senju, aunque fue amigo de la infancia de Hashirama durante el conflicto interminable, su amistad termina como resultado de la guerra. Como líder del clan Uchiha, el uso excesivo de Madara de Mangekyo Sharingan lo ciega, lo que lo obliga a tomar los ojos de su difunto hermano menor Izuna. Esto le permite a Madara utilizar su recién despertado Eternal Mangekyo Sharingan para continuar la guerra en curso entre los Uchiha y los Senju. En años posteriores, Hashirama sale con una oferta de paz entre los dos clanes. Aunque acepta tener paz con su antiguo rival, Madara siente que nunca será aceptado por el Senju y pierde la esperanza en Hashirama. Mientras trabaja para lograr este objetivo, Madara captura a Kurama the Nine-Tails y lo usa en un plan para destruir a Konoha. Se cree que Madara fue asesinada por la mano de Hashirama, pero él sobrevive y se esconde mientras toma una muestra de sangre de Hashirama con él para despertar a su Rinnegan. Durante este tiempo, Madara toma a Obito Uchiha como su agente y trasplanta su Rinnegan a Nagato para preservarlo para su eventual renacimiento años después.
Durante la mayor parte de la serie de Naruto, Obito usa el nombre de “Madara”, hasta que Kabuto Yakushi encuentra al verdadero Madara y lo reanima para chantajear a Obito en una alianza. A pesar de su acuerdo, Kabuto convoca a Madara para luchar contra la Alianza Shinobi. Madara logra cortar su conexión con la técnica de Kabuto mediante el uso de los signos de mano del Jutsu de Reanimación, derrotando a la mayoría de las fuerzas de la Alianza Ninja. Madara logra resucitar por completo según lo planeado sacrificando a Obito, convirtiéndose en el anfitrión del Ten Tails una vez que recupera uno de sus Rinnegan. Después de recuperar su otro ojo, Madara puede completar el Plan del Ojo de la Luna antes de verse traicionado por Black Zetsu, quien procede a convertirlo en un recipiente para el espíritu de Kaguya. Aunque liberado cuando Kaguya se volvió a sellar, la prueba puso a Madara arrepentida al borde de la muerte y muere pudiendo finalmente hacer las paces con Hashirama. En el anime japonés, Madara (y Obito con su disfraz de Madara) es interpretada por Naoya Uchida, mientras que Gou Inoue lo expresa de niño. En la versión en inglés, la voz de Madara es proporcionada por Neil Kaplan.